性味与归经方面，山茱萸味酸、涩，性微温，归肝、肾经，具有补益肝肾、收涩固脱的功效，常用于治疗肝肾亏虚所致的腰膝酸软、头晕耳鸣、阳痿遗精，以及虚汗不止、崩漏带下等症。现代药理研究表明，山茱萸含有山茱萸苷、熊果酸等成分，具有增强免疫、抗疲劳、降血糖等作用。

吴茱萸则味辛、苦，性热，有小毒，归肝、脾、胃、肾经，以散寒止痛、降逆止呕、助阳止泻为主要功效，多用于寒凝疼痛，如厥阴头痛、寒疝腹痛、寒湿脚气，以及胃寒呕吐、虚寒泄泻等病症。其主要化学成分包括吴茱萸碱、吴茱萸次碱等，具有镇痛、抗炎、抗溃疡等作用。