神经系统出现问题也是导致嗅觉下降的关键因素。头部受到撞击，可能直接损伤嗅神经，造成嗅觉突然丧失；脑部肿瘤压迫嗅神经传导通路，或是脑血管疾病引发局部缺血，都会影响嗅觉信号从鼻腔传递到大脑的过程。随着年龄增长，老年人的嗅觉功能逐渐衰退，这是因为嗅觉细胞数量减少，同时大脑对嗅觉信息的处理能力也在下降。
除了局部和神经系统因素，全身性疾病与药物副作用也不容小觑。糖尿病引发的神经病变，会损害嗅觉神经纤维；甲状腺功能减退导致的代谢紊乱，也可能影响嗅觉。长期服用某些降压药、抗抑郁药，药物成分可能干扰神经递质的正常运作，进而影响嗅觉感知。
